吉兆之门前的一块小石

　　吉兆之门前的一块小石表示伊斯兰先知穆罕默德曾在此展示旗帜。大维奇尔及军官在出征时会举行宗教仪式，然后带上该旗帜。

　　通过吉兆之门后便是第三庭院，又称为内宫，是托普卡匹宫的心脏地带。这里是一个翠绿的庭园，散布著私人宫殿、宝库(收藏着奥斯曼时代的贵重物品，包括宗教遗产)、后宫、亭楼等建筑物，艾哈迈德三世的图书馆则位于第三庭院的正中央。第三庭院的进出受到严格限制，禁止外人擅进。

　　第三庭院里到处都是男侍的寝宫，他们专责服侍苏丹。男侍都要学习艺术，如音乐、绘画及书法，表现出众者可成为“哈斯·奥达利·阿加”(先知圣迹的持有者、苏丹的私仆)，甚至是官员。

寝宫火炕

　　第三庭院由穆罕默德二世设计，其面积与第二庭院相当。第三庭院的设计严谨，不作大规模的修改。穆罕默德二世不再在后宫就寝后，继后的苏丹更为隐蔽，迁至更深入的第四庭院及后宫。

　　觐见大殿，又称为觐见大厅或请愿大殿，位于吉兆之门后方，遮挡着第三庭院。这方形的建筑物具土耳其特色，由二十二支圆柱组成的柱廊环绕在外，支撑著有悬檐的大屋顶。内里有一圆顶状的房间，还有两个相接、较细小的房间。为了对比在第二庭院的帝国议会，谨见大殿则称为“内议事厅”。觐见大殿历史悠久，建于十五世纪，在苏莱曼统治时加以装潢。苏丹会在这里坐上有篷的王位上接见维奇尔、官员及外使，听取意见。

　　觐见大殿的天花漆上青蓝色，以金色的星辰点缀，墙身的砖块都是蓝、白或青色的，并且配有珍贵的地毯及枕头，这可令到访者留下深刻的印象，同时不忘对苏丹的权力感到敬畏。1723年，艾哈迈德三世修建觐见大殿，1856年遭到大火破坏，及后重建至今日的面貌。今日所看见的觐见大殿内部和昔日有很大的差别。

　　25、觐见大殿的主入口。觐见大殿的两道前门与走廊相连，另有一个后门。前门是让官员和使者出入的，后门是苏丹专用的。前门的浮雕刻文具有苏丹字押，内容大体是赞美阿卜杜勒·迈吉德一世，注有1856年。门顶上刻划了太斯米(伊斯兰教义，意思是“奉至仁至慈真主之名”)，也注有刻划的年份－1723年，即艾哈迈德三世统治时期。门两面的镶板在后期的修缮工程里加上。

小水泉

　　苏莱曼一世在近门处加建了一个小水泉，不但用于清洗，其水声能阻止其他人听到秘密会议的谈话。波斯的诗词提到苏丹是“宽大、正义及仁善的泉源”，故水泉又可象征苏丹。

　　远征军寐宫位于觐见大殿后方的东面。由穆拉德四世在1635年兴建，艾哈迈德三世在十八世纪早期进行修复。远征军寐宫的屋顶呈拱形，由14支柱子支撑。现在的远征军寐宫收藏有价值不菲的帝国衣物多达2500件，当中大多是珍贵的苏丹长袍。这里亦收藏了约360件陶器制品。