满人入关后，清政府下令封禁长白山，因为满族相信长白山天池是自己的起源地。因此，在清朝末年之前，整个长白山地区被当做圣地对待，任何毁坏都要受到重罚。

　　当地县志里有过记载：康熙当朝时，曾派大臣武穆纳来长白山祭祖。走到讷殷部的旧址所在地——今天的白河林场，就被苍郁的树林阻碍，无法前进，只能遥拜而归。

　　清亡后，长白山陷入战乱和劫难。日军占领时期，长白山成为重要的木材输出地，树林成片消失。直到今天，当地人还能准确地指出日本人为了修建军车通道而砍倒树林的地方。

　　保护区成立以后，长白山能提供的经济资源，也成为当时调研报告中的重要内容。一份官方报告详细列出长白山能提供的经济产品：价值达1亿元的木材、各种毛皮、兽骨和中药，以及可供食用的动植物和观赏花卉。

　　天灾和人祸相继煎熬着这个物种宝库。1976年，台风从朝鲜半岛登陆，刮倒了保护区里的许多大树。