乾清宫建筑规模为内廷之首，明朝的十四个皇帝和清朝的顺治、康熙两个皇帝，都以乾清宫为寝宫，在这里居住，也在平时处理日常政务。作为明代皇帝的寝宫，自永乐皇帝朱棣至崇祯皇帝朱由检，共有14位皇帝曾在此居住。据记载，嘉靖年间发生十余个宫女趁嘉靖帝熟睡之时，企图勒死他的“壬寅宫变”后，世宗移居西苑，不敢回乾清宫居住。泰昌皇帝妃李选侍的“移宫案”，都发生在乾清宫。清代康熙皇帝以前，这里沿袭明制，清代顺治、康熙年间，乾清宫与政务关系相当密切，皇帝在这里读书学习、批阅奏章、召见官员、接见外国使节以及举行内廷典礼和家宴。自雍正皇帝移住养心殿以后，这里即作为皇帝召见廷臣、批阅奏章、处理日常政务、接见外藩属国陪臣和岁时受贺、举行宴筵的重要场所。一些日常办事机构，包括皇子读书的上书房，也都迁入乾清宫周围的庑房，乾清宫的使用功能大大加强。

　　乾清宫正殿宝座上方悬着由清代顺治皇帝御笔亲书的“正大光明”匾，这个匾的背后藏有密建皇储的“建储匣”。在当时，皇子之间夺取皇位的明争暗斗相当激烈。为了缓和这种矛盾，自雍正朝开始采取秘密建储的办法，即皇帝生前不公开立皇太子，而秘密写出所选皇位继承人的文书，一份放在皇帝身边；一份封在“建储匣”内，放到“正大光明”匾的背后。皇帝死后，由顾命大臣共同取下“建储匣”，和皇帝秘藏在身边的一份对照验看，经核实后宣布皇位的继承人。乾隆、嘉庆、道光、咸丰四帝，都是按此制度登上宝座的。到了清代后期，由于咸丰皇帝只有一个儿子，同治和光绪皇帝没有儿子，这种秘密立储的办法才失去其意义。

　　在乾清宫曾经举行过两次盛大的千叟宴，分别是在康熙六十一年(1722年)和乾隆五十年(1785年)。第二次的规模远大于第一次。凡是年龄在六十五岁以上的大臣、官吏、军士、民人、匠艺等，共有三千多人参加了乾隆皇帝举办的大宴会。席间，乾隆皇帝还召一品大臣和年龄九十岁以上的人到御座前，赐酒并赐予每人拐杖等物品。宴会上联句赋诗，共得诗数千首。

　　清代时，乾清宫还是皇帝死后停放灵枢的地方。即使皇帝死在其它地方，也要先把他的灵枢(也称梓宫)运往乾清宫停放几天，再转至景山内的观德殿，最后正式出殡。顺治皇帝死在养心殿，康熙皇帝死在畅春园，雍正皇帝死在圆明园，咸丰皇帝死在避暑山庄，他们的灵枢都曾被运回乾清官，停放在这里并按照规定举行祭奠仪式。

　　在乾清宫前露台两侧有两座石台，石台上各设一座鎏金铜亭，称做江山社稷金殿，口语也称其为金亭子。金殿深广各一间，每面安设四扇隔扇门，重檐。圆形攒尖式的上层檐上安有铸造古雅的宝顶，象征江山社稷掌握在皇帝手中。

　　在乾清宫露台南沿和御路、阶陛衔接处，有三个涵洞，高近两米左右，宽一米左右，名为“老虎洞”。据说，因为皇宫中等级森严，侍奉皇帝的内传不能登上露台和御路，只能在“老虎洞”中来往穿行。

　　乾清宫的南庑房有一南书房，据载，年少的康熙皇帝就在这里去除了鳌拜。当时康熙皇帝召见鳌拜，命赐茶。内侍用开水煮过的碗盛茶水，以盘端至鳌拜面前，鳌拜接茶时，因碗极热烫手，茶碗砰然坠地。鳌拜身后的内侍乘势一推原本做了手脚的椅子，鳌拜扑摔于地。康熙皇帝呼曰：“鳌拜大不敬”。一群健壮的少年立即涌出来将鳌拜擒获。