托马斯教堂(Thomaskirche)是1212年由迪特里希侯爵修建，结合了不同时代的许多建筑风格。在13世纪，它呈现罗马式的建筑风格，接下来的时期内它融合了包括哥特式风格以及巴罗克艺术风格和一些文艺复兴时期的元素。现在的托马斯教堂是在二战后重建的，巴赫的遗骸就被安放在这里。从1723开始年直到大师逝世（1750年），巴赫担任了这里的管风琴师兼合唱团指挥，他一生中最重要的创作始光就是在这里度过的，并且在这时诞生了《马太受难曲》等许多名曲。 教堂广场上的巴赫的纪念碑由Carl Steffner建于1908年。这位著名的音乐家被埋葬在教堂的圣坛中。在教堂的对面是巴赫纪念馆，博物馆内珍藏着巴赫和他的音乐。巴赫的墓地在教堂内主祭坛前面（入口向右的尽头）。大师一生奉献给了音乐，死后也沉浸在永恒的创作中――教堂内部用当年托马斯合唱团的古乐器作装饰。哥特式窗户的彩色玻璃上描绘的是马丁・路德、巴赫和第一次世界大战中的死难者。当一束阳光透过逼仄的彩窗，照射到镌刻着约翰-塞巴斯蒂安-巴赫（Johann Sebastian Bach）名字的青铜棺盖上面的时候，那些暗红色的大提琴或者是残破的皮鼓突然像是有了生命一般，莹莹地闪着光芒。 1539年圣灵降临节期间，宗教改革家马丁・路德曾在这里布道。