祀典武庙与大天后宫毗邻相接，位处明清两代府城行政中心，两者皆以丰美的文物及历史渊源，列属一级古迹。祀典武庙又称关帝庙，建于明郑时期，相传原为宁靖王府内之关帝厅，现貌是清康熙末年修缮，为本省武圣关帝之信仰中心，也是唯一列入官方祀典的武庙，庙分三进：前殿、拜殿、正殿及后殿，以长达66公尺的朱红山墙迤逦连接，彰显恢宏气势。

　　歇山屋脊的正殿中，供奉着金身关帝神像，左右陪祀周倉和关平，为清代康熙年间留下的古物，其上“万世人极”，为咸丰所赐御匾。相较一般庙宇，武庙的雕刻装饰显得精简无华，但雕工细腻，毫不逊色，雕刻内容则多以动植物等自然形物为主题，复加以高大厚实的门钉庙门，营造肃穆凝练的武人气质。后殿右侧，观音厅、西社与六和堂自成一区；西社乃府城诗社之一，昔日文人士子于此结社赋诗，为庄严肃穆的武庙增添几许文风；六和堂则是民间联境协防办事处，现为南管乐团“振声社”练习所，丝竹雅乐传唱不绝，庭前有一300年古梅，隆冬寒梅抽蕊怒放，吸引不少人到此赏梅。

　　大天后宫俗称台南妈祖庙，初建于明永历18年(1664年)，原为明郑时期宁靖王朱术桂之府邸，施琅克台后，以妈祖显灵协助破逆为由，奏请改建天妃宫，是台湾最早的官建妈祖庙，原称“天妃”的妈祖受封为“天后”，也由此庙开始。

　　天后宫是台湾仅存的明朝官家建物，虽经历次翻修，仍可见当年恢宏格局。三川门、拜殿、正殿、后殿，依地势逶迤延伸，级级高升。正殿右侧配置二进建筑，前殿大雄宝殿，后殿观音殿，奉祀之观音神像。镇殿妈祖端坐正殿，法相雍容庄重，相传乃泉州名师所塑，已有300年历史，千里眼、顺风耳两将陪祀在旁，栩栩如生；梁上悬满历代帝王御笔亲题及文武官员献颂名匾，赠匾之丰，冠绝全台，其中尤以康熙“辉煌海澨”、雍正“神昭海表”等6块清代御匾最富历史意义，亦彰显天后之崇高地位。