唐开元年间，改称开元寺。大历 4年（769年），禅宗高僧马祖道一行来寺说法，四方信徒云集洪洲，入室弟子139人，使开元寺成为江南佛学中心。

　　此后该寺时毁时修，先后易称过承天寺、能仁寺、永宁寺。相传明初朱元璋曾微服访此寺，被寺僧再三询问姓名而恼火，动怒在殿壁上题诗一首：“余尽江西数万兵，腰间宝剑摁留腥； 野僧不识山河主，只管叨叨问姓名 ”。题毕掷笔而去，扬言要对寺僧严加问罪。僧人甚惧，恰逢一云游僧宿此，即将原诗清掉，另题一首：御笔题诗不敢留，留时惟恐鬼神愁；好将江水频频洗，犹有毫光射斗牛。朱元璋正准备对寺僧问罪时，得知壁上新诗，怒气顿消，不但未再追究，反赞“ 寺内大有人在”。

　　佑民寺清朝顺治年间，改名佑民寺。嘉庆年间，在后殿铸铜接引佛一尊，高 1.6 丈，重3万千斤，南昌民谚“ 南昌穷是穷， 还有三万六千斤铜 ”即指此。1929年，寺易称“ 佑民寺”。“文革” 初期，寺及铜佛遭毁。1986 年 9 月以来，逐步重建，至 1991年初，山门、天王殿、大雄宝殿、药师殿、钟楼相继竣工，延僧开放，香火颇盛。 号称南昌“ 三宝”（佑民寺铜佛、钟楼铜钟、普贤寺铁象）中幸存的铜钟（南唐铸，重10064斤）现置于钟楼内。

　　据清乾隆年间版《 南昌府志》记载，南朝梁代时，豫章王师葛鲟宅居城西端，宅东南有蛟井。天监年间( 502—519)，井中“蛟斗甚激，豫章王萧综造大佛一尊，以镇蛟龙。”太清元年( 547 )，葛鲟捐宅建寺，供奉镇蛟大佛，寺名因称“大佛寺”。当时大佛寺开山祖师名号，现已不可考。

　　进入隋唐之际，大佛寺香火很盛。到唐开元年间(713-741)，大佛寺奉敕改称“开元寺”。此时寺中香火不减当年，梵音久播，声名远传， 不仅誉称中华，而且远至海外。据《中朝佛教文化交流史》等记载，开元年间之初，新罗( 今韩国)僧人金大悲。住于洪州开元寺(即今南昌佑民寺)。唐大历年间( 766—799 )， 洪州一度改名钟陵。 大历八年 ( 773 )，有中国禅宗八祖之尊的释道一移锡人住钟陵开元寺， 在此弘法长 15 年之久。释道一(709—788)，俗姓马，汉州什邡(今四川什邡县)人。幼年出家于邑内罗汉寺，20岁于渝州 ( 州治在今重庆 ) 圆律师座下受具足戒后，游学至南岳衡山 ( 今属湖南省 )，得释怀让以“磨砖不能成镜，坐禅岂能成佛”之开示，言下顿悟。而后，随侍释怀让9载，得授心印。数年后，释道一前往福建，开法于建阳佛迹岭(今属福建省)，广弘南宗顿悟宗风。唐天宝三年(744)前后，释道一率众迁锡江西。到大历八年(773)，释道一率众移住钟陵开元寺。