云髻山物种繁多，植物群落多种多样, 有常绿阔叶林、针阔叶混交林、马尾松、杉针叶林、竹林、山顶灌木林、稀树灌丛及灌木草坡等。这里有国家保护的珍稀树种：三尖杉、桫椤、格木、青钩栲等，二类保护树种有鹅掌揪、水松、杜仲、黄连、山玉桂、中华猕猴桃及枫柯群落、小果马蹄柯、细叶椽椎等。野生动物有云豹、金猫、蟒蛇、小爪水獭、黄腹角雉、娃娃鱼等国家一类保护动物和苏门玲、水鹿、毛冠鹿、大小灵猫、穿山甲、野猪、黄猄、果狸、竹鸡、画眉、豹、黑麂、蟒蛇、白鹇、林麝、水松、格木、巴戟、三尖杉等。云髻山旅游区面积9平方公里，分为山麓度假区、山地观光区、温泉疗养区、仙湖旅游区和鸳鸯湖休闲区五个功能分区。

　　区内旅游资源丰富，山、石、水、林、岩、泉组合巧妙，景点众多。石景有雄狮回眸、憨象施礼、金龟朝圣、天狗护邑、子母象、五指石、睡美人、救子观音、吊钟石等；水景有蕉风雨韵、竹影清波、新丰江之源、流云飞瀑、剑龙瀑、青龙瀑、仙湖、鸳鸯湖、西坑飞瀑等；岩洞有龙岩、扬州巷、仙公岩等。云髻山温泉属医疗保健型温泉，含氟、硅、钾、镁等多种对人体有益的微量元素，对治疗各种皮肤病、关节炎及消化系统疾病有一定的疗效。而且，这里四季景色各具特色：春赏山花，夏弄清风，秋观枫叶，冬踏冰雪，“风、花、雪、叶”尽在一山中。此外，新丰江之源瀑布落差128米，与瀑布岩石旁刻的中国书法家协会主席沈鹏先生题写的“新丰江之源”五个大字交辉相映，蔚为壮观。