南宋著名理学家和教育家朱熹任同安主簿时，增建经史阁、教思堂、苏公祠和志道斋。清乾隆三十二年（公元1767年）重建大成殿。

　　同安文物管理办公室的洪先生介绍说：“最早在五代时就有孔庙，但五代时的建筑由于时间的变迁，有些已经坏了，后来在原址的基础上重建，我们现在看到的是乾隆年间的建筑。旁边（南侧）还有（纪念宋代科学家苏颂的）苏公祠和（纪念理学名宦林希元的）林公祠，周围还有一些建筑群，由于时间流矢，慢慢有的就倒塌了，有的成了小学校舍，剩下古城墙、林公祠、苏公祠和大成殿。大成殿是乾隆年间建的（面积1050平方米，1987年又重新修葺。），原来是祭奠孔子的地方，现在成了（同安）博物馆。此外还有青云亭（观澜亭），兴贤育才牌坊，泮池等。”孔庙大门高4.4米，比泉州府庙的大门还高，孔庙主体大成殿为木砖石结构，重檐歇山式建筑，十五檩前廊后轩式，斗拱飞檐纵横交错，木雕内容丰富，技术高超。大成殿虽经沧桑，却仍然给人一种清淡文雅、沉静肃穆的感觉。

　　在“兴贤育才”牌坊的下面是半月形的放生池、石曲桥，北侧是石雕陈列场。

　　同安博物馆就设在孔庙内，占地7000多平方米，建筑面积1400多平方米，1986年筹建，1990年元月对外开放，馆藏文物及标本2000多件（套）。

　　同安博物馆设置两个展厅及一个露天陈列场。大成殿展厅有《同安重要史迹陈列》、《同安历史名人陈列》、《馆藏文物陈列》三个部分。史迹陈列，是通过图片、文字及文物资料，反映古同安新石器时代至新民主主义革命时期重要的历史事件及重要的历史人物的活动情况。