印度尼西亚的交通设施完善，不管何种交通方式，都可以满足旅客的出行要求。印尼的航空网以雅加达为中心，形成了完善的航空交通网；而火车则是以雅加达为始发站，来往于爪哇岛和苏门答腊岛间。

新加坡、马来西亚、泰国、香港、中国、巴基斯坦、欧洲和北美各国都有飞往印尼的航班，印尼国内各大城市间也都有航班相通。目前香港国泰航空公司、中国南方航空公司和印度尼西亚鹰航空公司已有从北京、广州到印尼雅加达和泗水的航线。
凡到巴厘岛的旅游者，可从雅加达、泗水乘印尼国内航班前往。雅加达至巴厘岛约需1小时30分。

印尼铁路多集中在爪哇岛，以雅加达为始发站，来往于爪哇岛和苏门答腊岛间。北线从雅加达经井里汶、三宝垄到泗水；南线从雅加达，经万隆、日惹到泗水，列车都是夕发朝至。

爪哇岛和苏门答腊岛上公路交通较发达，从雅加达、万隆、泗水等中心城市有通往周边地区的短距离高速公路，各大城市间有长途汽车往来。

印尼是个岛国，各主要岛屿间大多依靠轮渡和客轮相通，轮渡还可搭载游客的汽车。如走陆路从爪哇岛去苏门答腊岛，游客可先乘车至西爪哇北部西端的孔雀（Merak）港，然后搭乘轮渡穿过巽达海峡，到达苏门答腊南部楠榜省的巴果亥尼(Bakauheni)。从爪哇岛去巴厘岛，可从爪哇岛东端的外南梦（Banyuwangi）搭乘轮渡穿过巴厘海峡，到达巴厘岛西端的吉利马奴克（Gili-manuk）。 

公交
雅加达有多家公交公司，线路一般白天运营。有专为女性设置的专用公交。
地铁
印尼政府正准备在雅加达建设地铁，舒缓交通压力。预计在2014年前投入使用。
的士
印尼的的士服务发达，周六周日还有水上的士服务可以选择。