两栖爬行动物馆位于动物园西南部，紧邻鬯春堂，建于1979年，建筑面积4345平方米，曾经是北京动物园设施最好的馆舍之一。两爬馆分上下两层(由于改建现地下一层暂时停止展览)，设计有展厅、参观廊、展室、操作廊间、饲料饲养间等功能区块，馆内设置大小不一的展室90余个，展室面积根据展示的动物不同而有很大差异，用于饲养和展示扬子鳄的展厅面积最大，179平方米，展示蛇的展厅面积则不足1平方米。门厅左侧展示鳄、龟、鳖等爬行动物，最大的一间鳄鱼展室就位于此，门厅右侧楼下展示两栖动物，楼上展示蛇类，右侧展厅中央是饲养和展示网蟒的蟒蛇展厅，展厅贯通上下两层，长12米，宽6.4米，高11米展，厅中央用混凝土铸造了一棵假树供蟒蛇攀援，厅内有空调系统和湿度调节系统，这在1970年代的中国是非常先进的。两爬馆馆外西侧有三个室外活动场，与馆内鳄鱼展室相连，活动场用鳄鱼、青蛙等动物雕塑装饰，突出了两栖爬行馆的主题，展馆东侧室外临湖，依水建榭与主体建筑用回廊连结，并有跃层悬梯相连。两爬馆建筑形式活泼，功能完善，是1970年代和1980年代北京动物园最重要最成功的建筑之一。