清源洞，亦名纯阳洞，是清源山风景名胜区“山海大观”意境区内的主要景点之一。清源洞位于清源山顶峰，系清源山三十六岩洞之首，十人称之为“第一洞天”。进山门顺石阶而上左侧立有明万历三十六年（公元1068年）纪德碑一方，上刻：“泉山之句载于汉书，故以名州清源是也。四方宾客，本州士庶，乐慕名胜，游览不绝……”清源洞始建于南宋绍兴年间，有观空楼、佛祖殿，裴仙祠等建筑。相传南宋绍兴年间，有裴道人因追赶一条伤害生灵的巨蟒到此，见巨蟒遁入洞中，遂覆以石，坐化于洞口，使巨蟒不能复出为祸，故此洞又名“裴仙洞”。洞顶岩石，山藤攀挂，古色苍然。洞顶原建“千峰紫翠亭”，现只留下“蜕岩”、“羽化登仙”、“有仙则名”等历代石刻数方。在清源洞的长方形台地原址上，1998年重建了裴仙祠，观音殿和文昌阁。中峰绝顶的岩石上，有康熙六年（公元1667年）三韩曾延孔的“山海大观”石刻。明蔡清诗云：“一上第一山，自觉众山斜。真可谓山海奇观，一目了然。清源洞下方不远处，有明代抗倭名将俞大猷题刻。俞大猷（1503~1580年），字志辅，号虚江，泉州人，一生军伍40余年。因抗击倭寇，抵御外侮，功勋卓著，威名远扬，累官都督，与戚继光同为抗倭英雄，史称“俞龙戚虎”。后俞大猷功成引退，在石壁上亲笔题“君恩山重”四大字。此石为俞大猷少年时在此读书，翻腾跳跃，训练武功之地，又称“练胆石”。在东峰古道的石壁间，尚刻有俞大猷驱逐倭寇，收复莆田的记事石刻一方，是明代抗倭的珍贵史迹。清源洞的左峰，亦名东岩。其旁是遵岩，因唐代僧人可遵居此故名。可遵建有三塔，遗址尚存。“嘉靖八才子”之首的王慎中曾在遵岩读书，并著有《遵岩集》。明万历已酉（公元1609年）泉州太守姜志礼在岩面上手书“百丈坪”三大字，其岩石面宽阔平坦，亦为俞大猷练功习武之地。