草庵始建于宋代绍兴年间，初为草筑。元顺帝至元五年(公元1399年)改为石构歇山式建筑，面阔三开间，屋檐下用横梁单排华拱承托屋盖，简单古朴。 其中最为珍贵的是庵内依崖石雕一尊摩尼光佛，石浮雕摩尼跌坐神像，作圆圈浅龛，直径1.68米，坐像身长1.52米。奇妙的是佛像面部呈淡青色，手显粉红色，服饰为灰白色，是利用岩石中不同的天然三色精巧构设。佛像头部比较特别，呈现辉绿岩（青斗石）颜色，长方形面孔，背有毫光射纹饰，呈现花岗岩石质，散发披肩，端坐莲坛，面相圆润，眉弯稍为隆起，嘴唇薄，嘴角线深显，形成下额圆突，显得安祥自如；身穿宽袖僧衣，胸襟打结带，结带用圆饰套束蝴蝶形，而向两侧下垂于脚部，双手相叠平放，手心向上置于膝上，神态庄严慈善，衣褶简朴流畅，用对称的纹饰表现时代风格。 这尊摩尼光佛是目前世界仅存的一尊摩尼教石雕佛像，列为全国重点文物保护单位。在佛龛的左上角阴刻一段文字“谢店市信士陈真泽立寺，喜舍本师圣像，祈荐考妣早生佛地者。至元五年戌月日记”。五行楷书。在右上角还有阴刻比较粗糙的文字“兴化路罗山境姚兴祖，奉舍石室一完。祈荐先君正卿姚汝坚三十三宴，妣郭氏五九太孺，继母黄十三娘，先兄姚月涧，四学世生界者。”

据史料记载，摩尼教在我国旧称“明教”，公元三世纪波斯人摩尼所创始，其教义是杂揉佛教、基督教、祆教而成，崇拜光明，提倡清净，反对黑暗和压迫。 唐武后延载元年(公元694年)传入中国。 到明初，朱元璋嫌其教名上逼国号，遂驱逐信徒、毁坏寺院，摩尼教逐渐被其他宗教所融合。泉州草庵摩尼教寺成为仅存的珍贵史迹。 80年代初，此地曾发掘出宋代明教会的瓷碗，证实宋时泉州摩尼教已十分活跃。现代遗址为元代建筑物，据考古发现，宋代摩尼教已在这里活动。明代禁绝，此处乡民仍以佛教崇拜，保存完整。 1987年8月，瑞典隆德大学召开首届国际摩尼教学术讨论会，草庵摩尼佛造像作为讨论会的纪念性吉祥物。 1991年2月，联合国教科文组织的“海上丝绸之路”综合考察团参观草庵后，认为它是这次考察活动的“最大发现”。这为后来泉州申报“海上丝绸之路”起点提供有力的实证。 1996年被国家列为全国重点文物保护单位。 1998年日本“海上丝绸之路”考察团也来到草庵考察，专家学者认为，摩尼光佛是世界上惟一的保存最好的摩尼教遗迹。 ? 2011年8月，市政府投入巨资兴建草庵摩尼教遗址公园，未来的草庵公园，包括草庵宗教游览区、书院文化游览区、古寨文化山林区和田园生活休闲区等，致力将草庵景区规划成集休闲、旅游的著名景区，将草庵建设为“3A级”旅游景点,并将其打造为“爱国教育基地”，成为晋江市一张“闪亮的名片”。