该馆设在福建省华安县仙都镇、国家级文物保护单位的南阳楼内，是福建土楼唯一系统展示场所，由福建省文化厅主办，福建省文物局和华安县人民政府承办，永定县、南靖县人民政府协办。福建土楼博物馆分土楼民居、土楼建筑、土楼文化、关爱土楼四大部分，共有展室33间、总面积1200平方米、文物文献1000多件，其中国家级文物263件。土楼民居利用楼内一个单元的一至二层作为展馆，设置了厨房、餐厅、客厅、卧室、婚房以及私塾、纺间、厅间等，全面展示了大地土楼群蒋氏家族生产生活状况，显示了楼主豪富一方、书香门第的气息。楼内第三层作为福建土楼的展室。土楼建筑陈列了大量关于福建土楼的沿革、品类、建筑等文字材料及照片，全面系统地介绍了众多福建土楼这一世界伟大建筑工程的高超技术与价值，再现了人类祖先的聪明与智慧。土楼文化从楹联彩绘、土楼雕刻、土楼德信、土楼风情等四部分展示了福建土楼源远的文化底蕴，集中体现了耕读为本、忠孝仁义为德的中国传统思想文化，凸显了强烈的家庭整体意识和积极进取的人生态度。关爱土楼从国家立法、政府支持、群众参与等几部分说明政府与民众共同关注和保护福建土楼的行为规范。