日间火车 从东京乘JR东北新干线旋风列车，到终点站八户需要三个小时（座位需要预定）。之后从八户乘坐特急列车到函馆（需3小时）。从东京到函馆的单程车费约为18000日元，从大阪或京都到函馆的单程车费大约是28000日元。 往返函馆可以考虑利用日本铁路周游券（只针对国外游客）和从北东北观光中心到函馆的双人免费乘车券（针对一起出游的男女双人旅游团）。 夜间火车 每晚都有几趟从东京（上野站）到札幌的夜间火车，中途会在函馆暂时停车。一般会在次日凌晨4点左右到达函馆。另外，北斗星3号晚上7点从东京出发，于清晨6点到达函馆，时间比较合理。从函馆开出的夜间火车时间在21点和午夜出发。 日本海夜间火车在大阪/京都和函馆之间每夜营运，单程旅途大约需要17 个小时。一张最便宜的卧铺普通单程票花费约23000日元。

北海道中央巴士公司、道南巴士公司和北海道Kotsu 在函馆和札幌之间每天营运五班日行高速公路巴士和一班夜行巴士。单程旅程需要5.5小时，花费4680日元。