圣托里尼交通条件一般，游客可通过航空和水路上岛。岛上基本没有公共交通。

从国内乘国际航班飞往雅典，没有直飞航线，北京到雅典的国航航班（经停不转机）依然需要在慕尼黑下机，再重新上飞机。其它航线均需要转机。
飞机的特点就是快，只要45分钟就能到圣岛，但这些飞机都不大，爱琴海航空相对便宜，虽然不是廉价航空但类似亚航会有取消航班、改时间等等问题出现。奥林匹亚航空更好一些，但是价格更贵。
爱琴海航空：http://en.aegeanair.com/
便宜机票单程可以到25欧（税费再加35欧左右），一般时间不好（比如第一班5:30起飞），其它的航班可能要100多欧（含税），因此在费用方面至少要比坐船贵1倍多。
圣托里尼岛国际机场位于北面的卡马利，有定期航班，主要有雅典奥林匹克航空，爱琴海航空和水上飞机航空公司，从雅典到圣托里尼岛的飞行时间大约为45分钟。
奥林匹亚航空：http://www.olympicair.com/549-en-gb.cmt
机场有巴士到费拉，在这里你可以换乘到其他城镇的公共汽车。出租车也通常在机场等候，圣托里尼岛的许多酒店提供机场接送服务，通常是比出租车贵一些，但是却很值得，比出租车方便很多。

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圣托里尼岛在旅游旺季，每天都有往返各个小岛的轮船，从雅典的彼雷埃夫斯港口Pireaus到圣托里尼岛乘坐高速渡轮需要6小时，慢船8个小时，37.5-52.5欧不等。渡轮停靠在Athinios港口，可以换乘公交车和出租车往返伊亚，费拉和其他地方。所有车辆都要爬一个很陡的盘山公路。海运是依赖于天气的，所以出于安全考虑，特别是在冬天或下雨的天气里，游轮可能会延迟或取消到/离岸边，要时刻关注轮船信息。

岛上有公共巴士服务，票价1.6欧元、1.8欧元、2.2欧元，每半小时至1小时一班，时刻表可在网站http://www.ktel-santorini.gr/ 上查询。

驴是圣岛的一大特色，驴道位于圣岛老港港口至费拉镇镇口之间，输送游人和行李。这些伙计吃苦耐劳，也成了圣岛的一种风景，但是要小心它的排泄物随时会掉到你的脚边。

骑驴一趟的时间大约在20分钟左右。

在费拉镇老港港口可以乘坐缆车，缆车主要输送从港口到镇口之间的人群。从港口到镇口，一般需要1分多钟，缆车票单程4欧元，儿童票2欧元，行李票2欧元。旺季时需要提前买票，以免因排队耽误乘船时间，缆车票购买后要在30分钟内使用。