花莲与外界的交通较为便利。由台北、高雄等地可乘坐飞机抵达花莲机场。同时高雄与花莲之间也有客运轮船往返。此外，还可以乘坐纵贯全台湾的火车与汽车，便捷的由其他城市前往花莲。

花莲机场位于台湾花莲县新城乡，距市区约两公里，为一军民合用机场，民用部分称为花莲航空站，因邻近于新城乡北埔村而别称北埔机场。花莲航空站国内线有台北、台中、高雄直飞航班，国际线于日本、韩国、菲律宾、马来西亚等多个城市皆有往来航班。

以花莲站为中心，以北有北回线经宜兰、台北通往西部，以南则为花东线铁路，直迄台东，并与南回铁路接轨。凤林、光复、瑞穗、玉里、富里为境内主要车站。

花莲市及台中市间有花莲、丰原客运对开，惟车班甚少。花莲客运以花莲市为中心，分北线（崇德、天祥等地）、海线及南线（山线、花东纵谷）三路驶出；客运总站位于中山路的花莲旧火车站原址旁，除经明池往寿丰、铜门线的班车外，其余均经过花莲火车站。

基隆港至花莲港间有金航轮往返，每周五或周六自基隆出发，周日返航。

花莲客运以花莲市为中心，分北线（崇德、天祥等地）、海线及南线（山线、花东纵谷）三路驶出。除经明池往寿丰、铜门线的班车外，其余均经过花莲火车站。


花莲的出租车相当便利，除了上下班时间或夜间外，市区内几乎随时召得到车。出租车车身为黄色，起步费为80元或100元，每超过350米加跳5元。5公里约120元，10公里约180元，夜间时段另加费用。