主要保护对象为金丝猴等珍稀动物及其生存环境，在海拔1500米以上的落叶阔叶林与针阔叶混交林中，分布着14群，总数约1500只的金丝猴，是我国金丝猴种群数量最多、分布最集中的地区，近年来还曾多次发现白色金丝猴。

本区地处秦岭主脊之北侧，最高海拔2996米，相对高差近1800米，植被覆盖率达90。5%，是如今秦岭地区森林植被保存相对完整的区域；植被垂直分布比较明显，自下而上依次为针阔混交林带、桦木林带和亚高山针叶林带。区内植物种类复杂、资源丰富，高等植物有622种，其中属国家重点保护植物与省级保护植物20 多种。如今已经鉴定的种子植物121科522属1088种。木本植物465种，草本植物623种，珍稀濒危保护植物46种，植物特有性较高，特有植物504种。资源植物丰富,分为药用、观赏、食用等10大类。植物垂直分布明显，生态系统类型多样，其中森林面积53066 公顷，占总面积的94.1%。分布有10种国家级重点保护植物，其中稀有植物5种，濒危植物2种，渐危植物3种，并发现了大面积的独叶草(Kingdonia uniflora)及巴山冷杉(Abies fargesii)。国家Ⅱ级保护植物有银杏、大果青